Les Ateliers régionaux de formation de formateurs (ARFF) étaient destinés principalement aux jeunes universitaires des Balkans mais ils ont également associé des jeunes enseignants-chercheurs de l’Union européenne. Ces ateliers avaient pour objectif de créer de nouvelles pratiques sociales du savoir dans les Balkans, en permettant à de jeunes universitaires de nouer des liens à travers les frontières, malgré les processus de fragmentation hérités des guerres et des processus de transition qui prévalaient dans la région. Ils entendaient également créer des passerelles entre l'Europe de l'Ouest et l'Europe du Sud-Est, dans les domaines de l'enseignement supérieur et de la recherche.
Ils ont développé une analyse interdisciplinaire des concepts clefs dans le champ des sciences sociales et des humanités et les ont proposés comme autant d'outils indispensables à un niveau régional. Ils visaient enfin à contribuer à la réforme des curriculums existants.
C'est en 2002, et sur proposition du conseil scientifique de Transeuropéennes, composé de professeurs de l’Europe du Sud-Est, que les ateliers régionaux de formation de formateurs ont remplacé les Ateliers de coopération régionale (ACR).
Créés en 1997 par Transeuropéennes, avec le réseau d'universitaires des Balkans associé à ses activités, ils avaient pour but de faire converger les expériences et les réflexions des militants avec les analyses et recherches théoriques des universitaires et chercheurs. Systématiquement régionaux, par leur conception et par leurs participants, ces ateliers étaient aussi un remarquable lieu d'échange entre les générations.
Dans le cadre du renforcement de ses activités de soutien à l’autonomie des savoirs, les conseillers des programmes de Transeuropéennes réunis en assises en novembre 2001 ont souligné la nécessité d’engager un travail soutenu de formation des formateurs, en particulier les jeunes enseignants des universités des Balkans et les jeunes intellectuels militants, en adaptant pour leur profit les Ateliers de Coopération Régionale.
L’atelier de Saint-Denis, organisé en partenariat avec l’Institut Français de Géopolitique de l’université Paris 8, est la première des activités à avoir été organisée et lancée dans le cadre du programme plus vaste des Ateliers Régionaux de Formation de Formateurs que Transeuropéennes entend mettre en oeuvre durant une période de trois ans.